В профилактических и восстановительных цепях Кумыс Байкал принимают до или во время приёма пищи, запивая небольшим количеством теплой жидкости. Взрослым по 1-2 капсулы или по 3-4 таблетки в день;B детям по 1 капсуле или по 2 таблетки в день. Взрослым рекомендуется применять капсулированную форму, так как в кислой среде желудка, часть бактерий может погибнуть. В детской практике и геронтологии рекомендованы таблетки, потому что кислотность желудочного сока у детей и лиц пожилого возраста невысокая. Кратность и длительность приёма Кумыс Байкал зависит от исходного и текущего состояния организма. При остром течении кишечных инфекций, длительной кишечной дисфункции неустановленной этиологии; неспецифическом язвенном колите; хронических колитах и энтероколитах; дисбактериозах различной этиологии, в т. ч. вызванных применением антибиотиков, воспалительных заболеваниях иных органов и систем кратность приёма следует увеличить до 4-6 капсул или 6-8 таблеток в сутки. Приём, как правило, 7-9 дней. При запорах принимать 4 капсулы или 6 таблеток на ночь, после улучшения состояния доза может быть уменьшена наполовину. При регулярном применении курунгового кумыса у онкобольных до и после химиотерапии, как правило, устраняются рвота и понос. При этом на восстановительном и противорецидивном этапе следует соблюдать следующую кратность и дозировку: 1 капсула или 2 таблетки через 1,5-2 часа; перерывы во время сна.
Наиболее эффективно использование Кумыс Байкал с профилактической целью в дозировке 1-2 капсулы или 3-4 таблетки в день в виде 2-4 курсов в год по 30 дней. Для улучшения пищеварения и снижения токсической нагрузки на печень и почки можно принимать регулярно с приемом пищи. Целесообразен профилактический приём Кумыса Байкал в сочетании с пребиотиками (клетчатка, пектины, инулин). Ранняя профилактика дисбактериоза и иммунопатий новорождённых состоит в приёме курунгового кумыса беременными и кормящими женщинами и детьми в постнатальном периоде в виде напитка.